Το 1925 ιδρύεται το Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης που περιλαμβάνει τη Σχολή Φυσικών Επιστημών. Η Σχολή διαιρείται σε Τμήματα, αναλόγως των πτυχίων που απονέμει και το Τμήμα δέχεται τους πρώτους φοιτητές του το 1928. Το 1939 καθορίζονται οι τακτικές έδρες του Πανεπιστημίου και το 1954 το Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης μετονομάζεται σε Αριστοτέλειον Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης.
Το Τμήμα Φυσικής ιδρύεται το 1982 και το επόμενο έτος δημιουργείται η Σχολή Θετικών Επιστημών, στην οποία εντάσσεται το Τμήμα μαζί με τα τμήματα Χημείας, Βιολογίας, Γεωλογίας και Πληροφορικής. Το 1983 γίνεται η σύσταση των 5 Τομέων:
και το 1987 καθορίζονται τα γνωστικά τους αντίκειμενα.
Στο πλαίσιο αυτό, ξεκινά από το έτος 2024-25 μια σειρά δράσεων για τα 100 χρόνια του Tμήματος από ιδρύσεώς του, το 1928.